10月21日晚，513班在教二205教室开展了班级小讲堂的第三次活动。本次活动由来自华大基因的张鹏帆同学主讲，主题是班级同学在《生物信息学》课上疑问重重的内容：高通量测序原理。513班38名同学参与了本次活动。在小讲堂的开始，张鹏帆同学就《生物信息学》课程中的“全基因组de novo测序数据拼接组装算法流程”做了详细讲解，对同学们的一些疑问也做了详细的解答。
接着，本次小讲堂正式开讲。张鹏帆同学从DNA测序的历史出发，带领大家回顾了第一代测序原理（Sanger测序法）。1975年，Frederick Sanger及其同事，以及Alan Maxam和Walter Gilbert研究出两种不同的方法测定克隆的DNA片段中准确的碱基序列。这一激动人心的重大突破使分子生物学发生了革命，Sanger和Gilbert也因此获得1980年诺贝尔化学奖。Sanger DNA测序法采用双脱氧核苷酸终止DNA合成，产生一系列DNA片段，其大小可通过电泳检测。因为已经知道每个反应由哪种双脱氧核苷酸终止，因此每个片段的最后一个碱基都是已知的。将这些片段按照大小排列，每个片段比下一个片段多一个碱基（是已知的），就可以知道这段DNA的碱基顺序。
而后进入了本次的主题高通量测序，即第二代DNA测序。张鹏帆同学依然用二代测序法的创始人Jonathan Rothberg的相关创造历史为引子，对其创造的Roche 454测序仪的原理和详细使用方法做了说明。在讲到454测序仪的测序流程时，很多同学对其中的详细过程提出了疑问，张鹏帆同学都给出了详细解释，展示了扎实的专业基础。随后，他又对目前的主流测序仪Illumina的原理与测序流程做了详解介绍，也与同学们进行了深入的探讨，特别是在桥式PCR部分。张鹏帆同学为了让大家更好地理解，在黑板上详细画出了整个发生过程。其后，他又运用对比的手法，像大家介绍了如ABi Solid测序法和Ion Torrent测序法，说明了其测序原理与主流测序仪的不同及利弊。最后，张鹏帆同学像大家介绍了充满希望的第三代测序技术，较二代测序仪的不同是，三代测序仪所运用的是分子技术水平的，其中，Oxford Nanopre Technologies公司研究的纳米孔单分子技术是一种基于电信号测序的技术，而他觉得测序仪（方法）的不断的更新与变革，其实是将生物学上的问题转化成了物理问题。
学习是一个永无止境的过程，513班采用同伴教学的方式，不仅加深了同学情，也锻炼了主讲人。对于学习我们还有很长的路要走，不论前方道路如何，既然我们已经选择了，就努力认真地走下去。
下期预告：主题：基因组组装算法
主讲人：翁建聪（华大基因）
时间：2016年10月28日，晚6：30
地点：教二205
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