课题组简介：
计算生物学课题组主要通过分子动力学模拟、机器学习等理论与计算手段研究生物大分子结构和功能的关系。课题涉及生物、物理、化学及计算机等多个学科，属于典型的交叉研究领域。项目主要来源于国家自然科学基金、中科院科教融合项目、北京分子科学国家实验室开放基金及中国科学院大学自主部署项目。
课题负责人介绍：
张竹青，教授（博导）
2000-2005 中国科学院化学研究所高分子物理与化学国家重点实验室，博士
2005-2007 北京大学化学学院及定量生物学中心，博士后
2008-2011 加拿大多伦多大学医学院生物化学系，博士后
2011年6月至今 中国科学院大学生命科学学院，副教授、教授
课题组成员：
博士生： 闫庆琳
硕士生： 廖绍峰 张钰君 李旺书 王霆澜 文楚扬
研究方向：
（1） 蛋白质折叠及别构机制
（2） 翻译后修饰对天然无序蛋白质结构和功能的影响
（3） 生物大分子体系相分离的机制
近五年代表性论文：
- Xi Wang†, Xiang Zhou†, Qinglin Yan†, Shaofeng Liao, Wenqin Tang, Peiyu Xu, Yangzhenyu Gao, Qian Li, Zhihui Dou, Weishan Yang, Beifang Huang, Jinhong Li, Zhuqing Zhang*. LLPSDB v2.0: an updated database of proteins undergoing liquid-liquid phase separation in vitro. Bioinformatics. 2022:38(7):2010-2014 (†equal contribution)
- Qian Li†, Xiaojun Peng†, Yuanqing Li, Wenqin Tang, Jia'an Zhu, Jing Huang, Yifei Qi and Zhuqing Zhang*. LLPSDB: a database of proteins undergoing liquid–liquid phase separation in vitro. Nucleic Acids Res.2020:48:D320-327 (†equal contribution)
- Likun Zhao, Luhua Lai*, Zhuqing Zhang*. How calcium ion binding induces the conformational transition of the calmodu lin N-terminal domain-an atomic level characterization. Phys Chem Chem Phys. 2019,21;19795-19804.
- Yanhua Ouyang, Likun Zhao, Zhuqing Zhang*. Characterization of the structural ensembles of p53 TAD2 by molecular dynamics simulations with different force fields. Phys Chem Chem Phys. 2018,20:8676-8684.
- Jie Hu, Tao Chen, Moye Wang, Hue Sun Chan*, Zhuqing Zhang*. A critical comparison of coarse-grained structure-based approaches and atomic models of protein folding. Phys Chem Chem Phys. 2017,19:13629-13639.
研究成果图片：
蛋白质液-液相分离数据库LLPSDB（http://bio-comp.org.cn/llpsdb）
课题组成员合影：
